Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01656 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01656 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01656 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01656 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01656 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01656 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01656 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01656 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01656 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01656 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01656 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01656 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01656 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01656 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01656 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01656 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01656 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01656 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01656 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01656 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01656 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01656 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01656 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms