Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01654 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01654 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01654 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01654 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01654 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01654 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01654 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01654 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01654 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01654 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01654 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01654 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01654 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01654 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01654 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01654 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01654 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01654 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01654 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01654 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01654 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01654 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01654 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms