Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AfmO89020 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AfmO89020 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AfmO89020 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AfmO89020 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
AfmO89020 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AfmO89020 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AfmO89020 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AfmO89020 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AfmO89020 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AfmO89020 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AfmO89020 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AfmO89020 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AfmO89020 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AfmO89020 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AfmO89020 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AfmO89020 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AfmO89020 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AfmO89020 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AfmO89020 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AfmO89020 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms