Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcn2O88968 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms