Protein–RNA interactions for Protein: O88735

Map7, Ensconsin, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map7O88735 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map7O88735 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map7O88735 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map7O88735 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map7O88735 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map7O88735 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map7O88735 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map7O88735 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map7O88735 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map7O88735 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map7O88735 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map7O88735 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map7O88735 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Map7O88735 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Map7O88735 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Map7O88735 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Map7O88735 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms