Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms