Protein–RNA interactions for Protein: O88537

Fpr-rs3, Formyl peptide receptor-related sequence 3, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-rs3O88537 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Fpr-rs3O88537 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fpr-rs3O88537 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Fpr-rs3O88537 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Fpr-rs3O88537 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Fpr-rs3O88537 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Fpr-rs3O88537 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Fpr-rs3O88537 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Fpr-rs3O88537 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fpr-rs3O88537 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fpr-rs3O88537 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fpr-rs3O88537 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fpr-rs3O88537 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fpr-rs3O88537 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fpr-rs3O88537 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms