Protein–RNA interactions for Protein: O88491

Nsd1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd1O88491 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsd1O88491 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsd1O88491 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsd1O88491 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsd1O88491 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsd1O88491 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsd1O88491 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsd1O88491 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nsd1O88491 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nsd1O88491 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nsd1O88491 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsd1O88491 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsd1O88491 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsd1O88491 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsd1O88491 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nsd1O88491 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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