Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnt1O88346 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms