Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfdp1O88271 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfdp1O88271 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms