Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxq1O70220 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxq1O70220 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxq1O70220 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxq1O70220 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxq1O70220 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxq1O70220 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms