Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf5O70191 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf5O70191 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms