Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms