Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd70O55237 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd70O55237 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd70O55237 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd70O55237 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd70O55237 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd70O55237 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd70O55237 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms