Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FiglaO55208 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FiglaO55208 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FiglaO55208 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FiglaO55208 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FiglaO55208 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms