Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt5hO55201 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt5hO55201 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt5hO55201 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt5hO55201 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt5hO55201 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt5hO55201 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt5hO55201 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt5hO55201 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms