Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap1O55125 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms