Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp10O55123 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp10O55123 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms