Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg2O55111 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms