Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PrxO55103 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PrxO55103 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrxO55103 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrxO55103 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrxO55103 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrxO55103 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrxO55103 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrxO55103 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrxO55103 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrxO55103 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrxO55103 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrxO55103 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrxO55103 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrxO55103 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrxO55103 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrxO55103 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrxO55103 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PrxO55103 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrxO55103 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrxO55103 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrxO55103 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrxO55103 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PrxO55103 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrxO55103 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrxO55103 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrxO55103 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrxO55103 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrxO55103 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrxO55103 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms