Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb2O55029 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb2O55029 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb2O55029 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb2O55029 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms