Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bnip3O55003 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bnip3O55003 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms