Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NlkO54949 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NlkO54949 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NlkO54949 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NlkO54949 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NlkO54949 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NlkO54949 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms