Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb6O54946 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms