Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarce1O54941 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms