Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EdaO54693 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EdaO54693 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EdaO54693 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EdaO54693 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EdaO54693 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EdaO54693 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms