Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab33bO35963 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab33bO35963 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms