Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5r2O35926 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms