Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pik3cdO35904 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pik3cdO35904 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms