Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp2O35711 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms