Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppt2O35448 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppt2O35448 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms