Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CrcpO35427 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CrcpO35427 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrcpO35427 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms