Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc1O35379 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc1O35379 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.08■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms