Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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ColqO35348 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ColqO35348 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ColqO35348 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ColqO35348 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ColqO35348 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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ColqO35348 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ColqO35348 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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ColqO35348 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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ColqO35348 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ColqO35348 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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ColqO35348 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ColqO35348 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ColqO35348 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ColqO35348 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms