Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna6O35345 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna6O35345 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms