Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smad6O35182 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad6O35182 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad6O35182 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms