Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx3O35160 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms