Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc23O35125 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms