Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GclmO09172 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GclmO09172 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GclmO09172 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GclmO09172 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GclmO09172 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GclmO09172 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GclmO09172 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GclmO09172 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GclmO09172 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GclmO09172 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GclmO09172 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GclmO09172 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GclmO09172 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GclmO09172 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms