Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casq1O09165 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casq1O09165 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Casq1O09165 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq1O09165 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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