Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfra2O08842 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfra2O08842 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms