Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc3aO08576 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3aO08576 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms