Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsmbO08540 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MsmbO08540 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MsmbO08540 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
MsmbO08540 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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