Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm21310J3QQ23 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm21310J3QQ23 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm21310J3QQ23 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm21310J3QQ23 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm21310J3QQ23 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm21310J3QQ23 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm21310J3QQ23 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm21310J3QQ23 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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