Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700122O11RikJ3QPW6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700122O11RikJ3QPW6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms