Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Smim18J3QNP2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms