Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm21788J3QNH3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm21788J3QNH3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm21788J3QNH3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21788J3QNH3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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