Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6594J3QM43 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms