Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm21818J3KMS6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21818J3KMS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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