Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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